それらは私たちの肌、体の中に、そして街のいたるところに存在します。健康を維持するのに役立つものもありますが、病気を引き起こすものもあります。彼らは、目に見えず、多くの部分がまだ知られていない独自の関係やコミュニティを持ち、独自の世界を形成しています。私たちはバクテリア、真菌、ウイルス、つまり私たちと私たちの環境を複雑なネットワークで覆っている微生物について話しています。科学者たちは、私たちの皮膚、周囲の空気、さらにはコーヒーマシンや水道管の中にさえも見られる、予想外の種の多様性を発見したばかりです。
目に見えない地下生命体
このような発見に触発されて、国際的な研究者チームが野心的なプロジェクトを開始しました。彼らは、世界中の私たちの都市の隠れたマイクロバイオームをマッピングしたいと考えています。首都圏の地下鉄に生息する微生物に焦点を当てています。目的は、この目に見えない生命の世界地図を作成することです。
「地下鉄システムは、この世界に浸透するのに特に適しています」とベルリンのロベルト コッホ研究所 (RKI) 所長ローター ヴィーラー氏は説明します。 「それらはどちらも頻繁に利用される公共の場であり、生物の蔓延の重要な要因でもあります。同時に、地下に建設されているため、環境や気象条件の影響をほとんど受けません。」
ニューヨークが始まりました
この野心的なプロジェクトのきっかけとなったのは、ニューヨーク市の米国研究者らによる研究でした。彼らは、17 か月間にわたって、駅のベンチ、手すり、ゴミ箱、券売機、および地下鉄のさまざまな表面からサンプルを採取し、分析しました。彼らが発見したものは驚くべきものでした。DNA を使用して発見された微生物のほぼ半数は、これまでどこにも発見されたことがなかったのです。
こちらも興味深い点です。地下鉄の微生物の中には予想よりも病原体が少なく、その割合はわずか約 12% でした。しかし、これらの中には困難なものもありました。いくつかの耐性病原体に加えて、研究者らは炭疽菌の病原体である炭疽菌の DNA 断片、さらにはペストの病原体であるペスト菌に由来する DNA さえも発見しました。
ベルリンでもサンプリング中
このため、他の都市や地下鉄の微生物の世界も調べることがさらに楽しみになります。ベルリンは現在、MetaSub プロジェクトにすでに参加している 40 都市のひとつです。今後数週間で、ロベルト コッホ研究所 (RKI) の科学者たちがベルリンの地下鉄網全体を旅し、綿棒のようなものを使ってすべての主要な表面からサンプルを採取する予定です。
ベルリンからのすべてのサンプルはニューヨークの MetaSub 調整センターに送られ、そこで DNA が分離され分析されます。ロベルト コッホ研究所の研究者は、このようにして得られたデータをバイオインフォマティクス手法を使用して検査し、特に既知の細菌のゲノム部分と比較します。
科学者たちはすでにその結果を楽しみにしている。「実際、これらのマイクロバイオームとそれらがどのように機能するかについては、まだほとんどわかっていません」とウィーラー氏は言う。ベルリンのマイクロバイオームは他の都市と比べてどうですか?どの種を検出できますか?未知の微生物はいるのでしょうか？マイクロバイオームは時間の経過とともに変化しますか?都市の南部と北部の目に見えないコミュニティはおそらく異なるのでしょうか？ベルリンの地下鉄で現在収集されているサンプルは、これらおよびその他の疑問を解明するのに役立つ可能性があります。
出典: ロベルト・コッホ研究所 (RKI)、ベルリン市民協会 (BVG)
