スーパーコンピューターが細胞内の最小の生物学的構造の地図を描く

シミュレーション モデルは、ポアソン ボルツマン方程式を使用した粒子間の静電荷の計算に基づいています。これは、100万原子を超える規模の生物学的システムを表現できることを意味すると、同大学のJ. アンドリュー・マッキャモン氏とジョセフ・E・メイヤー氏は報告している。

このようにして、科学者たちは、細胞内輸送プロセスに関与する微小管や、タンパク質生産と細胞分裂で中心的な役割を果たすリボソームなど、細胞の重要な構造を原子レベルで説明します。研究者らは、完全に負に帯電している微小管上に孤立した正電荷があることを発見しました。リボソームの静電マップにより、細胞分裂中の遺伝情報の伝達中に安定化効果がある可能性のある分子サブユニットが研究者らに明らかになった。

膨大な計算能力に対処するために、1,100 個を超えるプロセッサを搭載したコンピューターが使用されました。スーパー コンピューターは、微小管システムの計算にわずか 1 時間もかかりませんでした。従来の計算方法では約350倍の時間と計算能力が必要だったという。研究者の成果は、米国科学アカデミー紀要（PNAS）誌のオンライン版に事前に掲載された。